Stai attualmente tentando di eseguire l'aggiornamento in base a una stringa, non a un ObjectId.
Assicurati di inizializzare un nuovo ObjectId dalla stringa durante la creazione della query:
mongoDB.getCollection("restaurants").updateOne(
new BasicDBObject("_id", new ObjectId("56110fe1f882142d842b2a63")),
new BasicDBObject("$set", new BasicDBObject("zipcode", "10462"))
);