prova a usare mongodump o mongoexport . https://docs.mongodb.org/manual/core/backups/
mongoexport fornisce un modo efficiente per esportare i dati dalla raccolta (tramite query se lo desideri)
mongodump crea un dump completo del database (backup) in modo da poterlo ripristinare facilmente ovunque, con gli stessi ID, riferimenti, indici. Tutte le tue cose
Puoi usare node.js child_process.exec per eseguire mongodump/mongoexport. Puoi usare linux crontab per la pianificazione dei backup. Tanti modi per organizzarlo con gli strumenti giusti
