La differenza tra i tempi di query dovrebbe essere quasi trascurabile, poiché entrambi limitano i limiti dell'id_univoco, quindi verranno trovati immediatamente. L'unico piccolo vantaggio qui va al count perché il db restituirà un int invece di un intero documento. Quindi il tempo che risparmi è puramente dovuto al trasferimento dei dati da db a client.
Detto questo, se il tuo obiettivo è fare un esiste query e non ti interessano i dati, usa il count
