MongoDB
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Creazione di una raccolta vuota in mongodb

Probabilmente il modo più efficiente per copiare una raccolta da un DB a un altro è usare mongodump /mongorestore dalla tua shell:

sh$ echo 'db.createCollection("some_collection")' | mongo my_dst_db 
sh$ mongodump  --db my_src_db --collection some_collection --out=- | \
    mongorestore --db my_dst_db --collection some_collection --dir=-

Il primo comando utilizzerà mongo per creare la raccolta di destinazione. Questo è necessario dato il tuo caso d'uso poiché, da quello che ho appena testato, mongorestore non creerà una raccolta vuota. Dopodiché, questo è solo un processo di dump/ripristino.

Tieni presente che mongodump accetterà un --query parametro nel caso sia necessario un parziale copia della tua collezione.