Puoi usare la proiezione MongoDB, ad esempio $project anche gli operatori della pipeline del framework di aggregazione. (modo consigliato). Se non vuoi usare project controlla questo link
db.collection.aggregation([{$progetto{ . . }}]);
Di seguito è riportato l'esempio per il tuo caso:
db.collectionName.aggregate
([
{ $project: { a: 1, 'b': '$subdoc.b', 'c': '$subdoc.c'} }
]);
Ti dà l'output come ti aspettavi, ad es.
{
"a" : 1,
"b" : 2,
"c" : 3
}
