Modificare la mappa dello schema del database di Entity Framework dopo aver usato prima il codice

EF utilizzerà dbo schema se non hai configurato lo schema in modo esplicito tramite annotazioni di dati o API fluente.

[Table("MyTable", "MySchema")]
public class MyEntity
{

}

Oppure

modelBuidler.Entity<MyEntity>().ToTable("MyTable", "MySchema");