Se stai utilizzando il tuo eseguibile da un percorso UNC, dovrai aggiungerlo nell'impostazione della zona in Intranet locale.
Su Internet Explorer, vai su Sicurezza e seleziona Impostazioni Intranet locale. Fai clic su Siti e aggiungi il tuo percorso UNC e fai clic su OK. Il protocollo file:// viene aggiunto automaticamente.
Questo non ha nulla a che fare con SSIS, ma ha tutto a che fare con le impostazioni della zona in Internet Explorer.
Questo dovrebbe aiutare.