Dalla documentazione di pyodbc
Per chiamare subito una stored procedure, passare la chiamata al metodo execute utilizzando un formato riconosciuto dal database o utilizzando il formato di escape della chiamata ODBC. (Il driver ODBC riformatterà quindi la chiamata in modo che corrisponda al database specificato.)
Per SQL Server useresti qualcosa del genere:
# SQL Server format
cursor.execute("exec sp_dosomething(123, 'abc')")
# ODBC format
cursor.execute("{call sp_dosomething(123, 'abc')}")
Quindi chiama la tua procedura
id_ = 'test'
pw = '12345'
depart = 'none'
class_ = 'GM'
name = 'name'
birthday = 'None'
grade = 3
subgrade = 2
sql = 'exec [my_database].[dbo].[my_table](?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)'
values = (id_, pw, depart, class_, name, birthday, grade, subgrade)
cursor.execute(sql, (values))