O pre-elabora il file CSV o (cosa che probabilmente farei) importa in una copia temporanea della tabella di destinazione e INSERT
solo colonne selezionate in un secondo passaggio:
CREATE TEMP TABLE tmp AS SELECT * FROM target_table LIMIT 0;
ALTER TABLE tmp ADD COLUMN etra_column1 text
, ADD COLUMN etra_column2 text; -- add excess columns
COPY tmp FROM '/path/tp/file.csv';
INSERT INTO target_table (col1, col2, col3)
SELECT col1, col2, col3 FROM tmp -- only reelvant columns
WHERE ... -- optional, to also filter rows
Una tabella temporanea viene eliminata automaticamente alla fine della sessione. Se l'elaborazione richiede più tempo, utilizza una tabella normale.