Una delle cause di ciò in passato sono stati i problemi con il percorso di importazione dei moduli.
In particolare, utilizzando un'installazione mod_wsgi compilata su una versione di Python, quindi utilizzando WSGIPythonPath o altri mezzi per impostare il percorso Python per fare riferimento a un ambiente virtuale Python costruito utilizzando una versione Python diversa.
Quindi, convalida per quale versione di Python mod_wsgi è stata compilata e installata. Se non è Python 2.7, ma una versione precedente di Python, puoi avere questo problema specifico.
Per come verificare quale mod_wsgi è stato compilato per l'uso:
http://code.google.com/p/modwsgi/wiki/CheckingYourInstallation #Libreria_condivisa_Python
http://code.google.com/p/modwsgi/wiki/CheckingYourInstallation #Python_Installation_In_Use
Potrebbe anche essere utile controllare anche le differenze di revisione a livello di patch di Python quando si guarda per cosa è stato compilato mod_wsgi. Ricordo che c'era un problema in un punto come questo tra Python 2.7.1 e 2.7.2 in merito.
Che i pacchetti del tuo sito Python siano in /usr/local, è possibile che mod_wsgi utilizzi una versione diversa in /usr.