Tavolo pivot con 3 tavoli

Sembra che tu possa avere un numero imprecisato di commissioni che desideri trasformare in colonne, in tal caso dovrai utilizzare le dichiarazioni preparate per interrogare questo:

SET @sql = NULL;
SELECT
  GROUP_CONCAT(DISTINCT
    CONCAT(
      'max(case when f.fee_name = ''',
      f.fee_name,
      ''' then f.fee_amount else 0 end) AS `',
      f.fee_name, '`'
    )
  ) INTO @sql
FROM fee f;

SET @sql = CONCAT('SELECT s.school_id, ', @sql, '
                    , sum(f.fee_amount) as Total
                  FROM students s
                  LEFT JOIN stud_fee sf
                    on s.id = sf.stud_id
                  LEFT JOIN fee f
                    on sf.fee_id = f.id
                   GROUP BY s.school_id');


PREPARE stmt FROM @sql;
EXECUTE stmt;
DEALLOCATE PREPARE stmt;

Vedi SQL Fiddle con demo