Puoi impostare il tuo delimeterType su "row" nel blocco di configurazione.
<configuration>
...
<delimiterType>row</delimiterType>
...
</configuration>
Tipo delimitatore
Maggiori informazioni su http://mojo.codehaus.org/ sql-maven-plugin/execute-mojo.html#delimiterType
Ad esempio:create-proc.sql
CREATE PROCEDURE ADD_BOOK (IN title VARCHAR(100))
BEGIN
-- your sql code
INSERT INTO Book (title) VALUES (title);
END
; -- this means the end of the sql command