L'utente 'root' per MySQL NON è lo stesso dell'utente root per l'accesso al computer, quindi non dovrebbero esserci effetti collaterali a condizione che tu conceda i diritti appropriati all'utente mysql sul server di produzione.
Questo è l'utente menzionato in
$ mysql -u user -p password db_name
che potrebbe condividere un nome con un utente che ha effettuato l'accesso al computer, ma non è necessario.
EDIT:nota:un utente normale può avviare mysql come root se viene utilizzata la password corretta nel comando sopra. Questo non sarà lo stesso di root password, se capisci cosa intendo.
Se non è chiaro dovresti assolutamente familiarizzare con il significato di "root" in un contesto MySQL.
