Django - Come collegarsi a un database legacy tramite intermediario?

Non sono sicuro se questo è ciò che stai chiedendo, ma puoi usare il through chiama in ManyToManyField per definire una tabella intermedia:

class Organization(models.Model):
    name = models.CharField(max_length=32)
    projects = models.ManyToManyField(Project, through="ProjectOrganisation")

class Project(models.Model):
    #Stuff Here

class ProjectOrganisation(models.Model):
    project = models.ForeignKey(Project)
    organization = models.ForeignKey(Organization)
    #Other Fields Here

Django lo fa automaticamente con molti campi comunque, solo se vuoi aggiungere campi extra, questo è il modo per farlo.