Un paio di opzioni:
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Investi in uno strumento di trasformazione dei dati che si connetta a NetSuite e DB2 o MySQL. Guarda Dell Boomi, IBM Cast Iron, ecc. Questi strumenti ti consentono di connetterti a entrambi i sistemi, definire i dati da estrarre, eseguire funzioni di trasformazione dei dati e mappature ed eseguire tutti gli inserimenti/aggiornamenti o qualsiasi altra cosa tu debba fare.
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Per MySQL a NetSuite, è possibile scrivere script php per accedere a MySQL e NetSuite. Sul lato NetSuite, puoi eseguire servizi Web SOAP o scrivere API REST personalizzate all'interno di NetSuite. SOAP è probabilmente un po' più lento di REST, ma con REST devi scrivere tu stesso l'API (JavaScript lato server:non è difficile, ma c'è una curva di apprendimento).
Spero che questo aiuti.