Sembra che tu usi InnoDB tabelle, quindi dovresti anche copiare i file ib* nella cartella dei dati (ma questo sovrascriverà qualsiasi tabella InnoDB creata nella nuova installazione.)
In alternativa (ancora meglio) puoi impostare il parametro 'datadir' nel file di configurazione e specificare il percorso della cartella dati nella vecchia installazione.
