ho creato array in PHP 5.6 con [] in PHP 7.1 danno errore fatale

A partire da PHP 7.1, quando accedi a una variabile non array (in questo caso una stringa) come un array, verrà generato un errore fatale.

Inizializza prima l'array, con $datos = []; . Questo sovrascriverà tutto ciò che hai impostato in precedenza e imposterà esplicitamente questa variabile come un array:

$result->execute();
$result->bind_result($id, $name);
$datos = [];
while($result->fetch()){
    $datos[]=array(
        $id => $name
    );
}

Se stai cercando di creare un array di $id => $name , il codice seguente dovrebbe funzionare:

$result->execute();
$result->bind_result($id, $name);
$datos = [];
while($result->fetch()){
    $datos[ $id ] = $name;
}