Mysql
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Aggiornamento della chiave primaria di MySQL

La prossima volta, usa una singola istruzione "alter table" per aggiornare la chiave primaria.

alter table xx drop primary key, add primary key(k1, k2, k3);

Per sistemare le cose:

create table fixit (user_2, user_1, type, timestamp, n, primary key( user_2, user_1, type) );
lock table fixit write, user_interactions u write, user_interactions write;

insert into fixit 
select user_2, user_1, type, max(timestamp), count(*) n from user_interactions u 
group by user_2, user_1, type
having n > 1;

delete u from user_interactions u, fixit 
where fixit.user_2 = u.user_2 
  and fixit.user_1 = u.user_1 
  and fixit.type = u.type 
  and fixit.timestamp != u.timestamp;

alter table user_interactions add primary key (user_2, user_1, type );

unlock tables;

Il blocco dovrebbe impedire l'arrivo di ulteriori aggiornamenti mentre lo stai facendo. Quanto tempo ci vuole dipende ovviamente dalle dimensioni del tuo tavolo.

Il problema principale è se hai dei duplicati con lo stesso timestamp.