Mi sono imbattuto anche in
problema utilizzando il seguente comando
mysqlcheck -u root -p --auto-repair -c -o --all-databases
Quello che ho fatto, ed è perché sono pigro lol, è stato eseguito tutto separatamente e usato il -r
per la riparazione invece di --auto-repair
mysqlcheck -u root -p -r --all-databases
mysqlcheck -u root -p -c --all-databases
mysqlcheck -u root -p -o --all-databases