Prova con questo. Puoi inserire la data nel formato gg/mm/aaaa come nella tua domanda...
SELECT * FROM activity_emp
WHERE STR_TO_DATE(server_date_time, '%d/%m/%Y')
BETWEEN STR_TO_DATE('29/08/2012', '%d/%m/%Y')
AND STR_TO_DATE('07/10/2012', '%d/%m/%Y')
Aggiornamento: Ti consiglio vivamente di cambiare il tipo di dati da VARCHAR
a DATETIME
Ciao!!!