MySQL e PHP:inserisci NULL anziché una stringa vuota

Per passare un NULL a MySQL, fai proprio questo.

INSERT INTO table (field,field2) VALUES (NULL,3)

Quindi, nel tuo codice, controlla if $intLat, $intLng sono empty , se lo sono, usa NULL invece di '$intLat' o '$intLng' .

$intLat = !empty($intLat) ? "'$intLat'" : "NULL";
$intLng = !empty($intLng) ? "'$intLng'" : "NULL";

$query = "INSERT INTO data (notes, id, filesUploaded, lat, lng, intLat, intLng)
          VALUES ('$notes', '$id', TRIM('$imageUploaded'), '$lat', '$long', 
                  $intLat, $intLng)";