Usa un CASE
espressione che controlla lo stato della colonna e tenta solo condizionatamente di analizzare come una data valida:
SELECT
MyColumn,
CASE WHEN REGEXP_LIKE(MyColumn, '^\s*\d\d\d\d\d\d\s*$')
THEN TO_CHAR(TO_DATE(TRIM(MyColumn), 'YYMMDD'), 'MM/DD/YYYY')
ELSE MyColumn END AS new_col
FROM MyTable
Ma come commento generale, dovresti evitare di memorizzare le informazioni sulla data nelle tabelle come testo. Ora stai vedendo uno dei motivi per evitarlo.